أولاً / بناء القدرات والمؤسسات وترسيخ مبدأ استقلالية المركز الأفريقي لدراسات الحوكمة والسلام والتحول.
ثانياً / حقوق الإنسان المرتبطة بالسلام والعدالة وعملية الانتقال.
ثالثاً / رفع مستوى الوعي بحقوق الإنسان.
رابعاً / السعي والعمل على مواءمة التشريعات والسياسات السودانية، بما في ذلك الدستور المرتقب، مع المواثيق الدولية لحقوق الإنسان التي صادق عليها السودان.
خامساً / إعداد تقارير عن حقوق الإنسان في السودان من خلال تقييم الحقوق وصولاً إلى واقع هذه الحقوق.
سادساً / حماية حقوق الإنسان في السودان عبر الرصد والمتابعة ومن خلال نظام فعال لتلقي الشكاوى.
سابعاً / السعي لبناء وتمكين العلاقات الإقليمية والتفاعل الإيجابي مع المؤسسات والآليات الدولية.

ستشكل هذه الأهداف الإستراتيجية السبعة الأساس لتطوير خطط عمل عامة وبرامج ذات أولوية محددة.
إلى جانب التوصيات التي تسهم في ترجمة ذلك إلى أنشطة متقنة في إطار أهدافها الكلية بمراحلها المختلفة والتفصيلية التي تراعي ما يستجد من أحداث ومستجدات مستقبلية.
وتعتمد مقومات نجاح تنفيذ هذه الإستراتيجية على: عزيمة الأطراف المعنية؛ وتوفير الموارد المطلوبة؛ والدعم الفني واللوجستي؛ وتعاون ومشاركة الشركاء من المجتمع المدني والمجتمع الدولي في مختلف مراحل التنفيذ.
وتتضمن الخطة الإستراتيجية المجتمع المدني بوصفه مستفيداً وداعماً. كما تحدد الخطة التعاون الوثيق مع الشركاء الدوليين والتنسيق المحكم مع مختلف الآليات الوطنية كركائز بالغة الأهمية لنجاح هذه الإستراتيجية. والأهم من ذلك كله، تبني نهج مؤسسي وقائم على العمل الجماعي لضمان نجاح الإستراتيجية وإنفاذها.